12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6820 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6820  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 76 aa  154  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.595087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2926  heavy metal transport/detoxification protein  62.16 
 
 		 71 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6874  hypothetical protein  70.42 
 
 		 76 aa  88.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6645  hypothetical protein  56.58 
 
 		 73 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352702  normal  0.381791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4949  hypothetical protein  54.29 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.638193  normal  0.129375 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3057  hypothetical protein  55.56 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.726798  decreased coverage  0.000436786 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6891  hypothetical protein  50.67 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3107  hypothetical protein  48.61 
 
 		 69 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00265  hypothetical protein  43.06 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.898664  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1498  hypothetical protein  41.1 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000455513  normal  0.0497856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3327  hypothetical protein  36 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4798  hypothetical protein  47.89 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>