12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3327 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3327  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  144  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6645  hypothetical protein  42.25 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352702  normal  0.381791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3107  hypothetical protein  33.82 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6891  hypothetical protein  42.47 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2926  heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 		 71 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1498  hypothetical protein  46.27 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000455513  normal  0.0497856 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6820  heavy metal transport/detoxification protein  36 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.595087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3057  hypothetical protein  45.59 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.726798  decreased coverage  0.000436786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4949  hypothetical protein  40.32 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.638193  normal  0.129375 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6874  hypothetical protein  40.62 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00265  hypothetical protein  34.78 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.898664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4798  hypothetical protein  36.11 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>