17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00265 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00265  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  144  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.898664  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6874  hypothetical protein  46.27 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6820  heavy metal transport/detoxification protein  43.06 
 
 
76 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.595087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4949  hypothetical protein  46.88 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.638193  normal  0.129375 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1498  hypothetical protein  43.28 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000455513  normal  0.0497856 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6891  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3057  hypothetical protein  38.46 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.726798  decreased coverage  0.000436786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2926  heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3107  hypothetical protein  37.31 
 
 
69 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592091  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6645  hypothetical protein  43.48 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352702  normal  0.381791 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3327  hypothetical protein  34.78 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  29.51 
 
 
1182 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
744 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
744 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
744 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
744 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
744 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>