45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1935 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  100 
 
 		 354 aa  726    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  50.14 
 
 		 371 aa  339  5e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  41.69 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  39.33 
 
 		 392 aa  222  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  33.63 
 
 		 337 aa  159  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  33.22 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  33.22 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  30.75 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  31.18 
 
 		 348 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  30.9 
 
 		 348 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  31.87 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  32.47 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  32.36 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  31.5 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  31.53 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  30.12 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  30.43 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  31.34 
 
 		 359 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  32.19 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  29.46 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  28.24 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  29.03 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  29.82 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  30.79 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  30.03 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  31.03 
 
 		 346 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  28.72 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  27.22 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  28.42 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  27.96 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  27.96 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  26.62 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  31.56 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  29.15 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  28.46 
 
 		 331 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  29.14 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  32.23 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  28.78 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  32.23 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  28.41 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  30.88 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  31.5 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  23.9 
 
 		 365 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  31.5 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  28.94 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>