45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0792 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  739    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  38.22 
 
 
348 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  35.28 
 
 
348 aa  182  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  34.51 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  35.61 
 
 
360 aa  180  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  36.53 
 
 
348 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  36.89 
 
 
343 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  36.89 
 
 
343 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  34.76 
 
 
349 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  32.42 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  34.94 
 
 
333 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  34.34 
 
 
333 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  34.34 
 
 
333 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  31.91 
 
 
333 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  32.18 
 
 
332 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  32.01 
 
 
363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  32.08 
 
 
333 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  34.28 
 
 
337 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  32.85 
 
 
331 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  35.4 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  34.37 
 
 
340 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  32.11 
 
 
341 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  29.75 
 
 
340 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  32.08 
 
 
330 aa  145  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  31.7 
 
 
329 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  29.79 
 
 
359 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  32.74 
 
 
335 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  32.28 
 
 
337 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  32.97 
 
 
335 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  31.32 
 
 
353 aa  137  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  31.91 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  35.74 
 
 
348 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  28.94 
 
 
334 aa  132  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  32.53 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  32.23 
 
 
336 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  29.41 
 
 
340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  30.47 
 
 
340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  33.2 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  33.2 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  26.84 
 
 
340 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  32.65 
 
 
346 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  32.11 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  27.17 
 
 
392 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  30.68 
 
 
371 aa  106  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  25.08 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>