45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0149 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  100 
 
 
335 aa  687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  92.54 
 
 
335 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  58.05 
 
 
340 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  56.76 
 
 
334 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  54.05 
 
 
340 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  53.47 
 
 
333 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  55.05 
 
 
340 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  51.36 
 
 
359 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  53.52 
 
 
337 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  52.27 
 
 
332 aa  358  6e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  53.47 
 
 
330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  57.01 
 
 
335 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  52.76 
 
 
329 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  51.36 
 
 
331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  52.6 
 
 
336 aa  338  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  52.91 
 
 
336 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  52.29 
 
 
336 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  51.24 
 
 
333 aa  335  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  51.22 
 
 
340 aa  334  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  50.62 
 
 
333 aa  332  7.000000000000001e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  49.38 
 
 
333 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  50.31 
 
 
333 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  50.31 
 
 
333 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  47.06 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  48.29 
 
 
348 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  40.28 
 
 
348 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  43.31 
 
 
337 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  38.99 
 
 
348 aa  183  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  34.94 
 
 
337 aa  178  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  40.15 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  42.59 
 
 
363 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  38.01 
 
 
349 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  37.5 
 
 
340 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  35.94 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  37.59 
 
 
341 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  35.94 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  38.11 
 
 
348 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  36.82 
 
 
360 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  33.1 
 
 
365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  31.34 
 
 
338 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  36.45 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  28.11 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  31.87 
 
 
354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  31.72 
 
 
392 aa  109  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  27.74 
 
 
371 aa  77  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>