36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_11760  acetyltransferase (GNAT) family protein  100 
 
 
387 aa  779    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0959824  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35570  acetyltransferase (GNAT) family protein  64.31 
 
 
373 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  41.46 
 
 
367 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2992  GCN5-related N-acetyltransferase  40.33 
 
 
363 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.723176  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0150  GCN5-related N-acetyltransferase  40.92 
 
 
378 aa  226  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3785  GCN5-related protein N-acetyltransferase  35.54 
 
 
368 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0643958  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2703  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
376 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0753229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  35.08 
 
 
374 aa  196  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0668932  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0325  hypothetical protein  39.94 
 
 
360 aa  190  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0137923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0184  GCN5-related N-acetyltransferase  42.91 
 
 
358 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.741033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
380 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0327579 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17530  hypothetical protein  34.59 
 
 
389 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.373422  normal  0.317256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6107  GCN5-related N-acetyltransferase  32.8 
 
 
341 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  36.55 
 
 
337 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20740  acetyltransferase (GNAT) family protein  37.19 
 
 
356 aa  139  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5102  GCN5-related N-acetyltransferase  33.68 
 
 
332 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0705936  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6109  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6110  GCN5-related N-acetyltransferase  33.21 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0914793  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6111  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 
337 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.634814  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
338 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000116384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5134  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
337 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3532  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 
336 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  33.45 
 
 
334 aa  91.3  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  36.18 
 
 
334 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00168273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
332 aa  89.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736196  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06170  hypothetical protein  36.91 
 
 
346 aa  88.6  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0361  GCN5-related N-acetyltransferase  28.9 
 
 
333 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33440  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.48 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0431  GCN5-related N-acetyltransferase  27.18 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0723  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00134722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8300  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
339 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4645  acetyltransferase  34.44 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158798  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2083  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45347  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6223  GCN5-related N-acetyltransferase  24.73 
 
 
332 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7043  hypothetical protein  27.44 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>