55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33440 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_33440  acetyltransferase (GNAT) family protein  100 
 
 
331 aa  670    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
338 aa  162  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000116384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  36.89 
 
 
332 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736196  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5134  GCN5-related N-acetyltransferase  37.9 
 
 
337 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6107  GCN5-related N-acetyltransferase  34.66 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6109  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6111  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.634814  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5102  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0705936  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6110  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 
338 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0914793  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17530  hypothetical protein  32.52 
 
 
389 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.373422  normal  0.317256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
374 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0668932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3785  GCN5-related protein N-acetyltransferase  30.12 
 
 
368 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0643958  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0184  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
358 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.741033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2703  GCN5-related N-acetyltransferase  30.03 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0753229 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  31.49 
 
 
367 aa  96.7  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0723  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
340 aa  96.3  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00134722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  33.2 
 
 
334 aa  95.9  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00168273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3532  GCN5-related N-acetyltransferase  32.07 
 
 
336 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 
334 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35570  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.21 
 
 
373 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
380 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0327579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0361  GCN5-related N-acetyltransferase  31.92 
 
 
333 aa  85.9  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11760  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.34 
 
 
387 aa  82.4  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0959824  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0431  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4645  acetyltransferase  28.57 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158798  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20740  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.63 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0150  GCN5-related N-acetyltransferase  29.96 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8300  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0325  hypothetical protein  30.82 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0137923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6223  GCN5-related N-acetyltransferase  26.64 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
337 aa  62.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2083  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45347  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2992  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.723176  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06170  hypothetical protein  28.27 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7043  hypothetical protein  29.38 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0058  GCN5-related N-acetyltransferase  26.41 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0059  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 
327 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.821201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2839  acetyltransferase, GNAT family  32.2 
 
 
167 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2454  acetyltransferase, GNAT family  33.05 
 
 
167 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  33.05 
 
 
167 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2856  acetyltransferase  32.23 
 
 
167 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.72924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0299  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
209 aa  49.3  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2834  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 
167 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000815753 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2877  acetyltransferase, GNAT family  31.58 
 
 
167 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0106791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2828  acetyltransferase  30 
 
 
167 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.738685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2553  acetyltransferase  30 
 
 
167 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2637  acetyltransferase  30 
 
 
167 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.439574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0457  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
310 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
320 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  25.91 
 
 
321 aa  46.2  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  26.46 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.163048  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  28.88 
 
 
634 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1054  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
331 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2588  acetyltransferase  31.58 
 
 
167 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00776025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>