39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4645 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4645  acetyltransferase  100 
 
 
338 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158798  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8300  GCN5-related N-acetyltransferase  45.48 
 
 
339 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3532  GCN5-related N-acetyltransferase  39.75 
 
 
336 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  31.99 
 
 
334 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00168273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5134  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6109  GCN5-related N-acetyltransferase  28.43 
 
 
339 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6223  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33440  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.56 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0361  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0325  hypothetical protein  39.19 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0137923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5102  GCN5-related N-acetyltransferase  29.02 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0705936  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3785  GCN5-related protein N-acetyltransferase  28.12 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0643958  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0431  GCN5-related N-acetyltransferase  29.6 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0723  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00134722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0184  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.741033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0327579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6107  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11760  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.79 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0959824  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6110  GCN5-related N-acetyltransferase  27.09 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0914793  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2992  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.723176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6111  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.634814  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000116384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0150  GCN5-related N-acetyltransferase  27.51 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2083  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45347  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 
332 aa  62.8  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736196  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17530  hypothetical protein  32.89 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.373422  normal  0.317256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35570  acetyltransferase (GNAT) family protein  26.06 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06170  hypothetical protein  34 
 
 
346 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2703  GCN5-related N-acetyltransferase  25.86 
 
 
376 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0753229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  24.6 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0668932  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  31.38 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20740  acetyltransferase (GNAT) family protein  26.62 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
634 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258584  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  26.6 
 
 
321 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7043  hypothetical protein  28.67 
 
 
325 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1054  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
331 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>