36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17530 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_17530  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  780    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.373422  normal  0.317256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  44.18 
 
 
380 aa  199  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0327579 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
367 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2992  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
363 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.723176  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0184  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
358 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.741033  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0150  GCN5-related N-acetyltransferase  38.49 
 
 
378 aa  169  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3785  GCN5-related protein N-acetyltransferase  32.48 
 
 
368 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0643958  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35570  acetyltransferase (GNAT) family protein  38.75 
 
 
373 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0325  hypothetical protein  41.32 
 
 
360 aa  156  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0137923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 
374 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0668932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11760  acetyltransferase (GNAT) family protein  34.59 
 
 
387 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0959824  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2703  GCN5-related N-acetyltransferase  33.67 
 
 
376 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0753229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6110  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 
338 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0914793  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6111  GCN5-related N-acetyltransferase  35.87 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.634814  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20740  acetyltransferase (GNAT) family protein  36.58 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6109  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 
339 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
338 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000116384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6107  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 
341 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
332 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736196  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5102  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0705936  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5134  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
337 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 
337 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33440  acetyltransferase (GNAT) family protein  33.58 
 
 
331 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06170  hypothetical protein  30.54 
 
 
346 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3532  GCN5-related N-acetyltransferase  31.27 
 
 
336 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
334 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00168273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0723  GCN5-related N-acetyltransferase  27.18 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00134722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8300  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2083  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45347  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0361  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0431  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4645  acetyltransferase  32.89 
 
 
338 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158798  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7043  hypothetical protein  28.4 
 
 
325 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6223  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
332 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>