15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3379 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3379  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000346578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0641  hypothetical protein  99.34 
 
 		 302 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0641  hypothetical protein  94.12 
 
 		 290 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000277282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4005  hypothetical protein  82.7 
 
 		 290 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0670  hypothetical protein  76.47 
 
 		 290 aa  448  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0597  hypothetical protein  73.7 
 
 		 290 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3671  hypothetical protein  73.7 
 
 		 290 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.286479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3854  hypothetical protein  74.05 
 
 		 290 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000149063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3728  hypothetical protein  72.56 
 
 		 290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2988  hypothetical protein  44.7 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0528  hypothetical protein  39.46 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.162869  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1854  hypothetical protein  27.82 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4083  hypothetical protein  23.72 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2242  hypothetical protein  28.1 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>