15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4005 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4005  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  594  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0641  hypothetical protein  83.79 
 
 		 290 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000277282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0641  hypothetical protein  82.35 
 
 		 302 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3379  hypothetical protein  82.7 
 
 		 302 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000346578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0597  hypothetical protein  80.97 
 
 		 290 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0670  hypothetical protein  77.93 
 
 		 290 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3671  hypothetical protein  79.58 
 
 		 290 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.286479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3854  hypothetical protein  80.62 
 
 		 290 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000149063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3728  hypothetical protein  79.42 
 
 		 290 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2988  hypothetical protein  44.04 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0528  hypothetical protein  41.77 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39040  hypothetical protein  31.52 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.162869  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1854  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2242  hypothetical protein  26.64 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4083  hypothetical protein  24.16 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>