13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0958 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0923  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0958  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0922  hypothetical protein  96.13 
 
 		 155 aa  227  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0907  hypothetical protein  83.66 
 
 		 154 aa  227  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00439506  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3456  hypothetical protein  83.01 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00269733  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2658  hypothetical protein  55.7 
 
 		 170 aa  167  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0415  hypothetical protein  30.87 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0427258  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0066669  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1556  hypothetical protein  31.03 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969834  normal  0.226901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1885  putative transmembrane protein  31.03 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00765988  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_003296  RS01728  hypothetical protein  30.6 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.906647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2628  hypothetical protein  35.48 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0242868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0612  hypothetical protein  34.62 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>