14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0415 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0415  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  301  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0427258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2658  hypothetical protein  30.53 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1801  hypothetical protein  35.86 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0066669  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0907  hypothetical protein  28.97 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00439506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2628  hypothetical protein  27.27 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0242868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0922  hypothetical protein  29.51 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1885  putative transmembrane protein  31.82 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00765988  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3456  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00269733  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01728  hypothetical protein  27.96 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.906647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0923  hypothetical protein  30.33 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0958  hypothetical protein  30.33 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1556  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969834  normal  0.226901 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0707  transmembrane protein  28.79 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.192149  normal  0.111144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3434  putative transmembrane protein  29.2 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.287018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>