18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0830 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0830  abortive infection protein  100 
 
 
250 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0802  abortive infection protein  94 
 
 
250 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3795  hypothetical protein  76.4 
 
 
250 aa  364  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0736  abortive infection protein  61.54 
 
 
255 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2940  Abortive infection protein  34.91 
 
 
247 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2373  abortive infection protein  34.5 
 
 
281 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0539  hypothetical protein  39.6 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2159  Abortive infection protein  32.79 
 
 
247 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1428  Abortive infection protein  37.11 
 
 
259 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1425  Abortive infection protein  32.29 
 
 
265 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2930  Abortive infection protein  30.42 
 
 
271 aa  99  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0096  hypothetical protein  30.2 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122908  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0926  abortive infection protein  26.12 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2645  hypothetical protein  29.29 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2515  hypothetical protein  29.29 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0063  abortive infection protein  29.07 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2800  hypothetical protein  32.2 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.612329  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3075  Abortive infection protein  32 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0704921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>