18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0539 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0539  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  463  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0736  abortive infection protein  39.51 
 
 
255 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2940  Abortive infection protein  41.15 
 
 
247 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0830  abortive infection protein  37.86 
 
 
250 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0802  abortive infection protein  39.18 
 
 
250 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2373  abortive infection protein  42.48 
 
 
281 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3795  hypothetical protein  35.95 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1428  Abortive infection protein  42.86 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2159  Abortive infection protein  37.55 
 
 
247 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0096  hypothetical protein  35.6 
 
 
263 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122908  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1425  Abortive infection protein  36.58 
 
 
265 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2930  Abortive infection protein  33.83 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3075  Abortive infection protein  44.36 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0704921  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2800  hypothetical protein  32.33 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.612329  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0926  abortive infection protein  32.66 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0063  abortive infection protein  43.86 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2515  hypothetical protein  30.77 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2645  hypothetical protein  30.77 
 
 
249 aa  55.1  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>