18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3795 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3795  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  497  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0830  abortive infection protein  76.4 
 
 		 250 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0802  abortive infection protein  74.8 
 
 		 250 aa  380  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0736  abortive infection protein  61.07 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2940  Abortive infection protein  38.72 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2373  abortive infection protein  34.62 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0539  hypothetical protein  38.42 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1428  Abortive infection protein  36.6 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2159  Abortive infection protein  30.33 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2930  Abortive infection protein  33.47 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0096  hypothetical protein  31.58 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1425  Abortive infection protein  33.18 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0926  abortive infection protein  28.95 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2645  hypothetical protein  26.56 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2515  hypothetical protein  26.14 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2800  hypothetical protein  33.2 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.612329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0063  abortive infection protein  28.76 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3075  Abortive infection protein  31.58 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0704921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>