18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2159 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2159  Abortive infection protein  100 
 
 
247 aa  474  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0802  abortive infection protein  32.79 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0830  abortive infection protein  33.6 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0736  abortive infection protein  32.65 
 
 
255 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3795  hypothetical protein  28.86 
 
 
250 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1425  Abortive infection protein  35.78 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2940  Abortive infection protein  33.76 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2930  Abortive infection protein  36.76 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2373  abortive infection protein  34.04 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1428  Abortive infection protein  50.52 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0096  hypothetical protein  31.02 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122908  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0539  hypothetical protein  36.49 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2800  hypothetical protein  31.5 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.612329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0063  abortive infection protein  42.05 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3075  Abortive infection protein  32.19 
 
 
255 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0704921  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2515  hypothetical protein  27.27 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2645  hypothetical protein  27.27 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0926  abortive infection protein  27.95 
 
 
272 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>