18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2056 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2056  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.818112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1919  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00249186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2161  hypothetical protein  93.68 
 
 		 95 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000779401  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2499  hypothetical protein  78.95 
 
 		 95 aa  154  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1857  hypothetical protein  69.47 
 
 		 111 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15692  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4537  hypothetical protein  64.21 
 
 		 95 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2251  hypothetical protein  64.21 
 
 		 95 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2264  hypothetical protein  64.21 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.171049  normal  0.166795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2165  hypothetical protein  64.21 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.098706  normal  0.356853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2120  hypothetical protein  64.21 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402815  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1822  hypothetical protein  58.95 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.215885  normal  0.562974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1882  hypothetical protein  51.65 
 
 		 95 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2052  hypothetical protein  53.68 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  normal  0.17807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2548  hypothetical protein  52.63 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473746  normal  0.0577041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2345  hypothetical protein  51.58 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.698308  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2058  hypothetical protein  52.63 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697247 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2121  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0881  hypothetical protein  38.71 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>