19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2058 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2058  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  191  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2548  hypothetical protein  63.16 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473746  normal  0.0577041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2052  hypothetical protein  57.89 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  normal  0.17807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2345  hypothetical protein  56.84 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.698308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2251  hypothetical protein  56.84 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4537  hypothetical protein  56.84 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2264  hypothetical protein  55.79 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.171049  normal  0.166795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2165  hypothetical protein  55.79 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.098706  normal  0.356853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2120  hypothetical protein  55.79 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402815  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1857  hypothetical protein  52.63 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15692  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2499  hypothetical protein  49.47 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1919  hypothetical protein  52.63 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00249186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2056  hypothetical protein  52.63 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.818112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1822  hypothetical protein  51.58 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.215885  normal  0.562974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2161  hypothetical protein  50.53 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000779401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1882  hypothetical protein  44.21 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2121  hypothetical protein  37.66 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0881  hypothetical protein  38.71 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0320  hypothetical protein  38.04 
 
 		 100 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000290892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>