18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2121 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2121  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  223  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95361  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2499  hypothetical protein  38.95 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2052  hypothetical protein  41.56 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  normal  0.17807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2161  hypothetical protein  36.84 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000779401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2056  hypothetical protein  36.84 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.818112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1919  hypothetical protein  36.84 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00249186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1882  hypothetical protein  40.26 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2548  hypothetical protein  40.26 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473746  normal  0.0577041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1822  hypothetical protein  41.56 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.215885  normal  0.562974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2264  hypothetical protein  35.79 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.171049  normal  0.166795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2165  hypothetical protein  35.79 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.098706  normal  0.356853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2120  hypothetical protein  35.79 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402815  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2345  hypothetical protein  41.56 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.698308  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1857  hypothetical protein  31.25 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15692  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2251  hypothetical protein  40.26 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4537  hypothetical protein  40.26 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2058  hypothetical protein  37.66 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0881  hypothetical protein  37.78 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>