18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2264 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2264  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.171049  normal  0.166795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2165  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.098706  normal  0.356853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2120  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402815  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2251  hypothetical protein  96.84 
 
 
95 aa  186  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4537  hypothetical protein  96.84 
 
 
95 aa  186  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1857  hypothetical protein  70.53 
 
 
111 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15692  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2161  hypothetical protein  64.21 
 
 
95 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000779401  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2052  hypothetical protein  58.95 
 
 
95 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  normal  0.17807 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1919  hypothetical protein  64.21 
 
 
95 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00249186  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2056  hypothetical protein  64.21 
 
 
95 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.818112 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2499  hypothetical protein  61.05 
 
 
95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2548  hypothetical protein  54.74 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473746  normal  0.0577041 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2058  hypothetical protein  55.79 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.697247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1822  hypothetical protein  58.95 
 
 
95 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.215885  normal  0.562974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2345  hypothetical protein  53.68 
 
 
95 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.698308  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1882  hypothetical protein  50.55 
 
 
95 aa  94.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2121  hypothetical protein  35.79 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0881  hypothetical protein  35.87 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.24156  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>