18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2052 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2052  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  normal  0.17807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2548  hypothetical protein  67.37 
 
 
95 aa  137  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473746  normal  0.0577041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2251  hypothetical protein  60 
 
 
95 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4537  hypothetical protein  60 
 
 
95 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2264  hypothetical protein  58.95 
 
 
95 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.171049  normal  0.166795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2165  hypothetical protein  58.95 
 
 
95 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.098706  normal  0.356853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2120  hypothetical protein  58.95 
 
 
95 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2058  hypothetical protein  57.89 
 
 
95 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.697247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2345  hypothetical protein  54.74 
 
 
95 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.698308  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1857  hypothetical protein  54.74 
 
 
111 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15692  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2161  hypothetical protein  53.68 
 
 
95 aa  100  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000779401  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2499  hypothetical protein  52.63 
 
 
95 aa  100  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1882  hypothetical protein  51.58 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1919  hypothetical protein  53.68 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00249186  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2056  hypothetical protein  53.68 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.818112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1822  hypothetical protein  46.32 
 
 
95 aa  87  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.215885  normal  0.562974 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2121  hypothetical protein  41.56 
 
 
110 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.95361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0881  hypothetical protein  38 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.24156  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>