26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1323 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1323  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  813    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0698643 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0935  4-alpha-L-fucosyltransferase  32.17 
 
 		 351 aa  96.3  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1124 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0640  4-alpha-L-fucosyltransferase  22.89 
 
 		 350 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0827  4-alpha-L-fucosyltransferase  26.95 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.447608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2125  4-alpha-L-fucosyltransferase  27.68 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0165  4-alpha-L-fucosyltransferase  29.52 
 
 		 361 aa  52.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0191  4-alpha-L-fucosyltransferase  30.83 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0131493  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0521  4-alpha-L-fucosyltransferase  30 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0170  4-alpha-L-fucosyltransferase  31.67 
 
 		 361 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.287995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3995  4-alpha-L-fucosyltransferase  27.59 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0214468  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4024  4-alpha-L-fucosyltransferase  29.17 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4128  4-alpha-L-fucosyltransferase  26.27 
 
 		 359 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.538398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4010  4-alpha-L-fucosyltransferase  27.12 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0156701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4305  4-alpha-L-fucosyltransferase  26.27 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0189898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4210  4-alpha-L-fucosyltransferase  27.12 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4183  4-alpha-L-fucosyltransferase  26.27 
 
 		 359 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.791178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4157  4-alpha-L-fucosyltransferase  26.27 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.792181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5226  4-alpha-L-fucosyltransferase  25.86 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0210  4-alpha-L-fucosyltransferase  29.13 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.475643  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03620  hypothetical protein  26.27 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03671  4-alpha-L-fucosyltransferase  26.27 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4194  4-alpha-L-fucosyltransferase  27.97 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0635033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4002  4-alpha-L-fucosyltransferase  27.5 
 
 		 361 aa  43.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.783054  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4256  4-alpha-L-fucosyltransferase  28 
 
 		 359 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>