29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0640 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0640  4-alpha-L-fucosyltransferase  100 
 
 		 350 aa  726    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2125  4-alpha-L-fucosyltransferase  38.75 
 
 		 355 aa  262  6.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0827  4-alpha-L-fucosyltransferase  39.43 
 
 		 347 aa  249  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.447608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0935  4-alpha-L-fucosyltransferase  36.31 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1124 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0210  4-alpha-L-fucosyltransferase  32.26 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.475643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4194  4-alpha-L-fucosyltransferase  29.97 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4002  4-alpha-L-fucosyltransferase  31.58 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.783054  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0165  4-alpha-L-fucosyltransferase  28.05 
 
 		 361 aa  97.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4153  4-alpha-L-fucosyltransferase  30.85 
 
 		 359 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.090997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4138  4-alpha-L-fucosyltransferase  30.85 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.359338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4315  4-alpha-L-fucosyltransferase  30.5 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4207  4-alpha-L-fucosyltransferase  30.5 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4256  4-alpha-L-fucosyltransferase  30.85 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0170  4-alpha-L-fucosyltransferase  26.78 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.287995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0521  4-alpha-L-fucosyltransferase  27.87 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4157  4-alpha-L-fucosyltransferase  29.57 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.792181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4305  4-alpha-L-fucosyltransferase  29.18 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0189898  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0191  4-alpha-L-fucosyltransferase  28.2 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0131493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5226  4-alpha-L-fucosyltransferase  29.57 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4128  4-alpha-L-fucosyltransferase  29.18 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.538398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4024  4-alpha-L-fucosyltransferase  28.2 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4210  4-alpha-L-fucosyltransferase  29.18 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03620  hypothetical protein  29.18 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03671  4-alpha-L-fucosyltransferase  29.18 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4183  4-alpha-L-fucosyltransferase  29.18 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.791178  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1323  hypothetical protein  22.78 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0698643 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4010  4-alpha-L-fucosyltransferase  28.79 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0156701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3995  4-alpha-L-fucosyltransferase  27.46 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0214468  normal  0.168346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>