24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0978 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0978  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1043  hypothetical protein  97.98 
 
 		 99 aa  197  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00136952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0982  hypothetical protein  97.83 
 
 		 92 aa  183  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.115066  normal  0.758455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1155  hypothetical protein  73.27 
 
 		 116 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3466  hypothetical protein  70.83 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00824967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3330  hypothetical protein  69.79 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1079  hypothetical protein  70.83 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3288  hypothetical protein  72.83 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2882  hypothetical protein  66.67 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3518  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.24461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3743  hypothetical protein  46.24 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0525  hypothetical protein  46.24 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000288648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3926  hypothetical protein  46.24 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00867622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3800  hypothetical protein  46.24 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133493  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0564  hypothetical protein  47.25 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3465  hypothetical protein  44.57 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0565  hypothetical protein  45.65 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0526  hypothetical protein  39.53 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000223061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0615  hypothetical protein  38.64 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000114861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3717  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000615361  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4335  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3312  hypothetical protein  44.83 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00209006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3143  hypothetical protein  38.89 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.720095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0446  hypothetical protein  32.26 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>