24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0446 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0446  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  174  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0615  hypothetical protein  51.76 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000114861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4335  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3518  hypothetical protein  46.99 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.24461  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3800  hypothetical protein  46.51 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133493  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0525  hypothetical protein  46.51 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000288648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3743  hypothetical protein  46.51 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3926  hypothetical protein  46.51 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00867622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3717  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000615361  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0564  hypothetical protein  43.37 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0565  hypothetical protein  42.17 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3465  hypothetical protein  39.76 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3143  hypothetical protein  56.52 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.720095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2882  hypothetical protein  37.35 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3312  hypothetical protein  40.48 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00209006  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00136952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0982  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.115066  normal  0.758455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3288  hypothetical protein  34.83 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3330  hypothetical protein  34.83 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3466  hypothetical protein  34.83 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00824967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1079  hypothetical protein  34.83 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0978  hypothetical protein  32.26 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1155  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0526  hypothetical protein  48.89 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000223061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>