24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0526 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0526  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  243  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000223061  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3800  hypothetical protein  48.94 
 
 
96 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133493  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0525  hypothetical protein  48.94 
 
 
96 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000288648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3743  hypothetical protein  47.87 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3926  hypothetical protein  47.87 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00867622  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0564  hypothetical protein  46.81 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3518  hypothetical protein  47.83 
 
 
96 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.24461  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3465  hypothetical protein  45.16 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0565  hypothetical protein  46.24 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3312  hypothetical protein  48.39 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3717  hypothetical protein  41.11 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000615361  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1043  hypothetical protein  40.7 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00136952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0978  hypothetical protein  39.53 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.164568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0982  hypothetical protein  40.7 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.115066  normal  0.758455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0615  hypothetical protein  43.62 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000114861  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2882  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3143  hypothetical protein  41.57 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.720095  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4335  hypothetical protein  41.3 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1155  hypothetical protein  34.88 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3288  hypothetical protein  33.72 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1079  hypothetical protein  33.72 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3330  hypothetical protein  32.56 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3466  hypothetical protein  32.56 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00824967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0446  hypothetical protein  48.89 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>