24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1079 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1079  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3466  hypothetical protein  97.92 
 
 
96 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00824967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3330  hypothetical protein  96.88 
 
 
96 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3288  hypothetical protein  98.91 
 
 
92 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2882  hypothetical protein  76.04 
 
 
96 aa  156  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1043  hypothetical protein  70.83 
 
 
99 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00136952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0978  hypothetical protein  70.83 
 
 
101 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.164568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0982  hypothetical protein  71.74 
 
 
92 aa  139  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.115066  normal  0.758455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1155  hypothetical protein  67.71 
 
 
116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3518  hypothetical protein  36.84 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.24461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3743  hypothetical protein  43.02 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3926  hypothetical protein  43.02 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00867622  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0525  hypothetical protein  43.02 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000288648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3800  hypothetical protein  43.02 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133493  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0564  hypothetical protein  45.98 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3465  hypothetical protein  42.05 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0565  hypothetical protein  43.18 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0615  hypothetical protein  38.64 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000114861  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4335  hypothetical protein  39.36 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3717  hypothetical protein  37.78 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000615361  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3312  hypothetical protein  42.53 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00209006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0526  hypothetical protein  33.72 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000223061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3143  hypothetical protein  35.16 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.720095  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0446  hypothetical protein  34.83 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>