18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3552 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3552  acyltransferase 3  100 
 
 		 382 aa  766    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  23.7 
 
 		 656 aa  53.1  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  23.26 
 
 		 362 aa  52.8  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  22.76 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  21.28 
 
 		 352 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  25.9 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0302  acyltransferase 3  24.26 
 
 		 592 aa  47.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0821  hypothetical protein  25.16 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000016225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6989  acyltransferase-like protein  25.36 
 
 		 395 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  26.78 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  27.15 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  27.33 
 
 		 715 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  23.38 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  23.62 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  24.73 
 
 		 667 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  25.17 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  32.8 
 
 		 376 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  26.67 
 
 		 360 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>