26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3186 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3186  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  643    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.46732  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0008  hypothetical protein  33.87 
 
 
327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2762  hypothetical protein  27.86 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0667  hypothetical protein  31.07 
 
 
314 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1478  hypothetical protein  27.5 
 
 
317 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2842  hypothetical protein  29.07 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139293  hitchhiker  0.000000000000178909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3676  hypothetical protein  27.67 
 
 
314 aa  95.9  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2609  hypothetical protein  27.41 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.051078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1997  hypothetical protein  27.93 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0760  hypothetical protein  27.33 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000614648  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0013  hypothetical protein  21.71 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0013  hypothetical protein  21.71 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2459  hypothetical protein  40 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.190883 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0131  membrane protein-like  28.27 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0867832  normal  0.324559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4932  hypothetical protein  26.9 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0823915  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0653  membrane protein-like protein  27.22 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.547059  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2540  hypothetical protein  21.14 
 
 
308 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2536  hypothetical protein  25.42 
 
 
321 aa  52.8  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000281952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4011  hypothetical protein  23.98 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0458856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3304  membrane protein-like protein  25.83 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3414  IG hypothetical 15508  19.87 
 
 
308 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00386324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4352  membrane protein-like protein  21.43 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2213  hypothetical protein  27.92 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2444  hypothetical protein  28.66 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497862 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2821  hypothetical protein  28.66 
 
 
193 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5598  hypothetical protein  19.05 
 
 
311 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0121359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>