27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2842 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2842  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139293  hitchhiker  0.000000000000178909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0667  hypothetical protein  49.03 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3676  hypothetical protein  44.69 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1478  hypothetical protein  41.61 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2762  hypothetical protein  40.33 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0760  hypothetical protein  33.55 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000614648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2609  hypothetical protein  33.55 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.051078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3186  hypothetical protein  29.07 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.46732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1997  hypothetical protein  33.71 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0008  hypothetical protein  28.2 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3304  membrane protein-like protein  26.34 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3414  IG hypothetical 15508  25.47 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00386324  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2821  hypothetical protein  30.77 
 
 		 193 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2444  hypothetical protein  30.77 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5659  hypothetical protein  22.26 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5337  hypothetical protein  22.87 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000137644  hitchhiker  0.000000122299 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0653  membrane protein-like protein  24.16 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.547059  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5168  hypothetical protein  22.26 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5152  hypothetical protein  22.26 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000091778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4352  membrane protein-like protein  22.96 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5720  hypothetical protein  22.26 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000676136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5324  hypothetical protein  22.26 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5264  hypothetical protein  21.5 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165043  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2459  hypothetical protein  27.18 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190883 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5581  hypothetical protein  21.93 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.747160000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23330  predicted membrane protein  26.58 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000027962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2540  hypothetical protein  27.49 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>