14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3676 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3676  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  617  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2762  hypothetical protein  54.55 
 
 
314 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1478  hypothetical protein  54.66 
 
 
317 aa  326  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0667  hypothetical protein  42.99 
 
 
314 aa  255  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2842  hypothetical protein  43.73 
 
 
315 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139293  hitchhiker  0.000000000000178909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0760  hypothetical protein  42.9 
 
 
322 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000614648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2609  hypothetical protein  37.71 
 
 
317 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.051078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0008  hypothetical protein  30.19 
 
 
327 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3186  hypothetical protein  26.37 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.46732  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1997  hypothetical protein  28.51 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0653  membrane protein-like protein  25.35 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.547059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2459  hypothetical protein  25.43 
 
 
320 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.190883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3414  IG hypothetical 15508  21.36 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00386324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4352  membrane protein-like protein  22.12 
 
 
319 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>