18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2444 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2444  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  569  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497862 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2821  hypothetical protein  99.48 
 
 
193 aa  363  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2822  hypothetical protein  98.15 
 
 
118 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0667  hypothetical protein  24.16 
 
 
314 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1478  hypothetical protein  26.39 
 
 
317 aa  45.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443079 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4011  hypothetical protein  25.93 
 
 
312 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0458856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2762  hypothetical protein  26.53 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3186  hypothetical protein  28.66 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.46732  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2842  hypothetical protein  30.56 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139293  hitchhiker  0.000000000000178909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5168  hypothetical protein  22.73 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5598  hypothetical protein  21.74 
 
 
311 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0121359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5152  hypothetical protein  22.73 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000091778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5622  hypothetical protein  23.31 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5659  hypothetical protein  25.88 
 
 
312 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1997  hypothetical protein  26.83 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5720  hypothetical protein  22.73 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000676136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5324  hypothetical protein  22.73 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5337  hypothetical protein  22.28 
 
 
311 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000137644  hitchhiker  0.000000122299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>