42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2257 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2257  transposase, IS4  100 
 
 		 125 aa  260  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3447  transposase IS4  68.22 
 
 		 389 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3183  transposase IS4  68.22 
 
 		 389 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3141  transposase IS4  68.22 
 
 		 389 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3039  transposase IS4  68.22 
 
 		 389 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000331814  normal  0.984797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2507  transposase IS4  68.22 
 
 		 389 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3567  transposase IS4  68.22 
 
 		 389 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1315  transposase IS4  68.22 
 
 		 389 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1683  transposase IS4  68.22 
 
 		 389 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000475694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2093  transposase IS4  68.22 
 
 		 389 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2386  transposase IS4  68.22 
 
 		 389 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0140  transposase, IS4 family protein  67.29 
 
 		 389 aa  156  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.745984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0350  transposase IS4 family protein  44.86 
 
 		 382 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2370  transposase IS4 family protein  44.86 
 
 		 389 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1836  transposase, IS4 family protein  44.76 
 
 		 389 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2339  transposase, IS4 family protein  44.76 
 
 		 389 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1138  transposase, IS4  41.67 
 
 		 389 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2223  transposase IS4  40.38 
 
 		 389 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.285308  normal  0.571436 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5422  IS4 family transposase  34.62 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2141  ISGsu1, transposase, interruption  33.68 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0299  ISGsu1, transposase  33.68 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2180  ISGsu1, transposase  33.68 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0957  ISGsu1, transposase  33.68 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0252  ISGsu1, transposase  33.68 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0986  putative transposase  32 
 
 		 376 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2974  transposase IS4 family protein  30.39 
 
 		 312 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2344  transposase IS4 family protein  30.69 
 
 		 261 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.718047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2646  transposase IS4 family protein  30.39 
 
 		 372 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1289  transposase, IS4 family protein  34.62 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0870  transposase IS4 family protein  32.69 
 
 		 381 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100589  normal  0.585839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0509  transposase IS4 family protein  32.69 
 
 		 381 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0772109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3686  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 		 412 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3953  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 		 412 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4150  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 		 412 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.277384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4154  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 		 412 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4418  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 		 412 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000316762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5316  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 		 412 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5490  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 		 412 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5869  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 		 412 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6486  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 		 412 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0808322  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0552  transposase IS4 family protein  31.73 
 
 		 381 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2900  transposase IS4 family protein  32.14 
 
 		 381 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00460334  normal  0.33461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>