22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1289 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1289  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 78 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0350  transposase IS4 family protein  73.08 
 
 		 382 aa  110  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2370  transposase IS4 family protein  71.43 
 
 		 389 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2339  transposase, IS4 family protein  71.79 
 
 		 389 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1836  transposase, IS4 family protein  71.79 
 
 		 389 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3447  transposase IS4  44.16 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0140  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.745984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3183  transposase IS4  44.16 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3141  transposase IS4  44.16 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3039  transposase IS4  44.16 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000331814  normal  0.984797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2507  transposase IS4  44.16 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2386  transposase IS4  44.16 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2093  transposase IS4  44.16 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1683  transposase IS4  44.16 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000475694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1315  transposase IS4  44.16 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3567  transposase IS4  44.16 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1138  transposase, IS4  44.74 
 
 		 389 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2223  transposase IS4  43.28 
 
 		 389 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.285308  normal  0.571436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2257  transposase, IS4  34.62 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5422  IS4 family transposase  38.16 
 
 		 389 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2372  hypothetical protein  58.97 
 
 		 53 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0986  putative transposase  35.29 
 
 		 376 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>