16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1509 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1509  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0637375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1897  hypothetical protein  42.71 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000610159  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0037  nodulation efficiency protein NfeD  35.09 
 
 		 452 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280773  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  37.84 
 
 		 438 aa  50.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 452 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  31.46 
 
 		 456 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  39.56 
 
 		 455 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  29.55 
 
 		 488 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  29.07 
 
 		 433 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  39.66 
 
 		 473 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  33.85 
 
 		 459 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  26.04 
 
 		 141 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  30.68 
 
 		 467 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  31.51 
 
 		 460 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  34.29 
 
 		 510 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  50 
 
 		 388 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>