48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2896 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2896  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2916  hypothetical protein  38.91 
 
 
314 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2913  hypothetical protein  30.89 
 
 
328 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2927  hypothetical protein  26.76 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  30 
 
 
1061 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1667  Ankyrin  28.67 
 
 
509 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1144  hypothetical protein  27.71 
 
 
2122 aa  54.3  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  40.24 
 
 
296 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  28.78 
 
 
483 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  25.84 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  26.11 
 
 
426 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  26.76 
 
 
450 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  29.32 
 
 
1156 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  27.67 
 
 
1585 aa  51.2  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0002  ankyrin  26.62 
 
 
578 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  24 
 
 
790 aa  50.8  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19610  ankyrin repeat-containing protein  28.89 
 
 
353 aa  49.3  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  27.92 
 
 
855 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  26.7 
 
 
4520 aa  48.5  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  27.34 
 
 
254 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  23.6 
 
 
865 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.34 
 
 
2413 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  26.29 
 
 
445 aa  46.6  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  26.17 
 
 
715 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0978  ankyrin repeat-containing protein  32.89 
 
 
369 aa  46.6  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.90033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  31.82 
 
 
305 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0502  ankyrin repeat-containing protein  29.82 
 
 
354 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  22.5 
 
 
494 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  31.73 
 
 
196 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  22.4 
 
 
490 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 
1133 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  24.81 
 
 
347 aa  44.3  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03541  conserved hypothetical protein  25.99 
 
 
568 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000863572  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2350  ankyrin  35.71 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  27.45 
 
 
870 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  27.98 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  26.61 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  28.24 
 
 
2171 aa  43.9  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  30.83 
 
 
404 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  26.88 
 
 
1249 aa  43.5  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  32.76 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  29.17 
 
 
157 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  30.23 
 
 
382 aa  42.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1878  hypothetical protein  26.44 
 
 
806 aa  42.7  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2693  ankyrin repeat-containing protein  27.94 
 
 
933 aa  42.7  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.82952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3653  ankyrin repeat-containing protein  23.12 
 
 
195 aa  42.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  25.51 
 
 
269 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  24.83 
 
 
287 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>