34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2391 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2278  propanediol utilization protein PduU  100 
 
 		 116 aa  217  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2178  propanediol utilization protein PduU  100 
 
 		 116 aa  217  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2391  propanediol utilization protein PduU  100 
 
 		 107 aa  217  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2225  propanediol utilization protein PduU  99.07 
 
 		 107 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147147  normal  0.371458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2232  propanediol utilization protein PduU  98.13 
 
 		 116 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2296  propanediol utilization protein pduU  91.59 
 
 		 116 aa  202  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0886  ethanolamine utilization protein EutS  63.89 
 
 		 116 aa  147  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1732  microcompartments protein  61.32 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2649  microcompartments protein  57.41 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1290  microcompartments protein  61.68 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.772924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4902  microcompartments protein  58.88 
 
 		 117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3276  microcompartments protein  57.94 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2615  ethanolamine utilization protein EutS  57.94 
 
 		 111 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2837  ethanolamine utilization protein EutS  57.94 
 
 		 111 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2704  ethanolamine utilization protein EutS  57.94 
 
 		 111 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2730  ethanolamine utilization protein EutS  57.94 
 
 		 111 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2663  ethanolamine utilization protein EutS  57.94 
 
 		 111 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1215  microcompartments protein  57.01 
 
 		 111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3683  ethanolamine utilization protein EutS  57.01 
 
 		 111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02353  predicted carboxysome structural protein with predicted role in ethanol utilization  57.01 
 
 		 111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2608  ethanolamine utilization protein EutS  57.01 
 
 		 111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02315  hypothetical protein  57.01 
 
 		 111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1208  microcompartments protein  57.01 
 
 		 111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.912592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2739  ethanolamine utilization protein EutS  57.01 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2591  ethanolamine utilization protein EutS  57.01 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1372  microcompartments protein  56.48 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1227  microcompartments protein  58.88 
 
 		 120 aa  126  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3264  putative propanediol utilization protein (PduU)  58.33 
 
 		 119 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1938  microcompartments protein  53.27 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2828  ethanolamine utilization protein EutS  55.14 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31386  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1040  microcompartments protein  61.11 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0087  microcompartments protein  54.21 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1419  microcompartments protein  51.4 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1176  microcompartments protein  44.14 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00405057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>