34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1372 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1372  microcompartments protein  100 
 
 		 115 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3264  putative propanediol utilization protein (PduU)  73.68 
 
 		 119 aa  174  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0886  ethanolamine utilization protein EutS  62.28 
 
 		 116 aa  151  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1040  microcompartments protein  64.35 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2649  microcompartments protein  56.64 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2232  propanediol utilization protein PduU  55.26 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2178  propanediol utilization protein PduU  55.26 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2278  propanediol utilization protein PduU  55.26 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2296  propanediol utilization protein pduU  54.39 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1290  microcompartments protein  60.18 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.772924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2391  propanediol utilization protein PduU  56.48 
 
 		 107 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1938  microcompartments protein  56.52 
 
 		 112 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2225  propanediol utilization protein PduU  56.48 
 
 		 107 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147147  normal  0.371458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3276  microcompartments protein  57.66 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1732  microcompartments protein  51.82 
 
 		 115 aa  123  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4902  microcompartments protein  59.22 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02353  predicted carboxysome structural protein with predicted role in ethanol utilization  54.95 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1215  microcompartments protein  54.95 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2608  ethanolamine utilization protein EutS  54.95 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02315  hypothetical protein  54.95 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3683  ethanolamine utilization protein EutS  54.95 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1208  microcompartments protein  54.95 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.912592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2739  ethanolamine utilization protein EutS  54.95 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2591  ethanolamine utilization protein EutS  54.95 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1227  microcompartments protein  56.36 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2837  ethanolamine utilization protein EutS  52.68 
 
 		 111 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0087  microcompartments protein  50.44 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2615  ethanolamine utilization protein EutS  52.68 
 
 		 111 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2704  ethanolamine utilization protein EutS  52.68 
 
 		 111 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2730  ethanolamine utilization protein EutS  52.68 
 
 		 111 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2663  ethanolamine utilization protein EutS  52.68 
 
 		 111 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2828  ethanolamine utilization protein EutS  53.15 
 
 		 135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31386  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1176  microcompartments protein  45.69 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00405057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1419  microcompartments protein  53.04 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>