34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2608 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2739  ethanolamine utilization protein EutS  100 
 
 		 135 aa  224  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2591  ethanolamine utilization protein EutS  100 
 
 		 135 aa  224  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1208  microcompartments protein  100 
 
 		 111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.912592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02315  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3683  ethanolamine utilization protein EutS  100 
 
 		 111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02353  predicted carboxysome structural protein with predicted role in ethanol utilization  100 
 
 		 111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2608  ethanolamine utilization protein EutS  100 
 
 		 111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1215  microcompartments protein  100 
 
 		 111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2828  ethanolamine utilization protein EutS  98.2 
 
 		 135 aa  219  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31386  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2837  ethanolamine utilization protein EutS  94.59 
 
 		 111 aa  214  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2615  ethanolamine utilization protein EutS  94.59 
 
 		 111 aa  214  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2704  ethanolamine utilization protein EutS  94.59 
 
 		 111 aa  214  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2730  ethanolamine utilization protein EutS  94.59 
 
 		 111 aa  214  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2663  ethanolamine utilization protein EutS  94.59 
 
 		 111 aa  214  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1227  microcompartments protein  66.67 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1290  microcompartments protein  62.39 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.772924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1938  microcompartments protein  58.18 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2296  propanediol utilization protein pduU  56.88 
 
 		 116 aa  133  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2232  propanediol utilization protein PduU  57.8 
 
 		 116 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4902  microcompartments protein  55.86 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2278  propanediol utilization protein PduU  56.88 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2178  propanediol utilization protein PduU  56.88 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2225  propanediol utilization protein PduU  57.94 
 
 		 107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147147  normal  0.371458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3276  microcompartments protein  54.05 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2391  propanediol utilization protein PduU  57.01 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0886  ethanolamine utilization protein EutS  52.25 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2649  microcompartments protein  51.79 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1372  microcompartments protein  54.95 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0087  microcompartments protein  53.21 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1732  microcompartments protein  47.75 
 
 		 115 aa  114  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1040  microcompartments protein  53.15 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3264  putative propanediol utilization protein (PduU)  50.45 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1176  microcompartments protein  44.35 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00405057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1419  microcompartments protein  51.33 
 
 		 113 aa  92.8  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>