34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1176 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1176  microcompartments protein  100 
 
 		 119 aa  243  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00405057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0886  ethanolamine utilization protein EutS  50.42 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1732  microcompartments protein  47.9 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1938  microcompartments protein  49.14 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4902  microcompartments protein  47.83 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3264  putative propanediol utilization protein (PduU)  43.97 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1372  microcompartments protein  45.69 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1208  microcompartments protein  44.35 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.912592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3683  ethanolamine utilization protein EutS  44.35 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2608  ethanolamine utilization protein EutS  44.35 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1215  microcompartments protein  44.35 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02315  hypothetical protein  44.35 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2739  ethanolamine utilization protein EutS  44.35 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02353  predicted carboxysome structural protein with predicted role in ethanol utilization  44.35 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2591  ethanolamine utilization protein EutS  44.35 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2649  microcompartments protein  49.14 
 
 		 117 aa  97.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3276  microcompartments protein  46.96 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1290  microcompartments protein  44.54 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.772924  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2663  ethanolamine utilization protein EutS  44.35 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2730  ethanolamine utilization protein EutS  44.35 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2837  ethanolamine utilization protein EutS  44.35 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2704  ethanolamine utilization protein EutS  44.35 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2615  ethanolamine utilization protein EutS  44.35 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1227  microcompartments protein  44.64 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0087  microcompartments protein  43.97 
 
 		 112 aa  93.6  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2178  propanediol utilization protein PduU  44.64 
 
 		 116 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2278  propanediol utilization protein PduU  44.64 
 
 		 116 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2828  ethanolamine utilization protein EutS  42.61 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31386  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2232  propanediol utilization protein PduU  43.75 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2391  propanediol utilization protein PduU  44.14 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2296  propanediol utilization protein pduU  42.5 
 
 		 116 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2225  propanediol utilization protein PduU  43.24 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147147  normal  0.371458 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1040  microcompartments protein  43.97 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1419  microcompartments protein  41.38 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>