34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1290 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1290  microcompartments protein  100 
 
 		 114 aa  227  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.772924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3276  microcompartments protein  69.03 
 
 		 117 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4902  microcompartments protein  69.03 
 
 		 117 aa  159  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0886  ethanolamine utilization protein EutS  61.21 
 
 		 116 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0087  microcompartments protein  59.82 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2649  microcompartments protein  56.03 
 
 		 117 aa  140  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1208  microcompartments protein  62.39 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.912592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02315  hypothetical protein  62.39 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3683  ethanolamine utilization protein EutS  62.39 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2608  ethanolamine utilization protein EutS  62.39 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1215  microcompartments protein  62.39 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02353  predicted carboxysome structural protein with predicted role in ethanol utilization  62.39 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2739  ethanolamine utilization protein EutS  62.39 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2591  ethanolamine utilization protein EutS  62.39 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1227  microcompartments protein  61.68 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2837  ethanolamine utilization protein EutS  60.91 
 
 		 111 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2663  ethanolamine utilization protein EutS  60.91 
 
 		 111 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2730  ethanolamine utilization protein EutS  60.91 
 
 		 111 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2615  ethanolamine utilization protein EutS  60.91 
 
 		 111 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2704  ethanolamine utilization protein EutS  60.91 
 
 		 111 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2278  propanediol utilization protein PduU  62.04 
 
 		 116 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2178  propanediol utilization protein PduU  62.04 
 
 		 116 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2391  propanediol utilization protein PduU  61.68 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2828  ethanolamine utilization protein EutS  60.55 
 
 		 135 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2225  propanediol utilization protein PduU  61.68 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147147  normal  0.371458 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2296  propanediol utilization protein pduU  60.19 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2232  propanediol utilization protein PduU  61.11 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1732  microcompartments protein  57.41 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3264  putative propanediol utilization protein (PduU)  61.06 
 
 		 119 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1938  microcompartments protein  56.25 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1372  microcompartments protein  60.18 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1419  microcompartments protein  58.56 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1040  microcompartments protein  58.41 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1176  microcompartments protein  44.54 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00405057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>