18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2278 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2278  antitermination protein  100 
 
 		 250 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0140366  hitchhiker  2.0380900000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4452  antitermination protein  95.6 
 
 		 250 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000674008  unclonable  0.00000000121493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1766  antitermination protein  90 
 
 		 250 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2084  antitermination protein  88.8 
 
 		 250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000058866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2077  antitermination protein  88.4 
 
 		 250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3153  antitermination protein Q  39.56 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000826081  hitchhiker  0.0000000000302422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1846  antitermination protein Q  39.56 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000732258  hitchhiker  0.00000000166006 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1261  antitermination protein Q  39.93 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00132968  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1442  antitermination protein Q  40.29 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0683  gp23  37.07 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000011637  decreased coverage  0.0000000557011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1132  antitermination protein Q  35.53 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.93895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1062  antitermination protein Q  35.53 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125216  hitchhiker  0.00000357923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1094  antitermination protein Q  35.16 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3883  antitermination protein Q  34.9 
 
 		 207 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0302  antitermination protein Q  35.29 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10027  late gene regulator  34.9 
 
 		 207 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00412931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00725  hypothetical protein  34.9 
 
 		 207 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00315899  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3126  antitermination protein  41.33 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>