20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0302 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0302  antitermination protein Q  100 
 
 		 207 aa  434  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10027  late gene regulator  99.03 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00412931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00725  hypothetical protein  99.03 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00315899  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3883  antitermination protein Q  98.07 
 
 		 207 aa  428  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3153  antitermination protein Q  32.12 
 
 		 273 aa  134  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000826081  hitchhiker  0.0000000000302422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1846  antitermination protein Q  32.12 
 
 		 273 aa  134  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000732258  hitchhiker  0.00000000166006 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0683  gp23  34.48 
 
 		 267 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000011637  decreased coverage  0.0000000557011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1766  antitermination protein  34.38 
 
 		 250 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4452  antitermination protein  34.51 
 
 		 250 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000674008  unclonable  0.00000000121493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2278  antitermination protein  35.29 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0140366  hitchhiker  2.0380900000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1261  antitermination protein Q  31.39 
 
 		 273 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00132968  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1442  antitermination protein Q  30.29 
 
 		 273 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2077  antitermination protein  34.38 
 
 		 250 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38064  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2084  antitermination protein  33.98 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000058866  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0392  antitermination protein Q  98.11 
 
 		 53 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000173193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1094  antitermination protein Q  26.01 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1132  antitermination protein Q  26.01 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.93895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1062  antitermination protein Q  26.01 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125216  hitchhiker  0.00000357923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3126  antitermination protein  51.76 
 
 		 151 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1688  hypothetical protein  25.7 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>