52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1208 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1208  protein of unknown function DUF86  100 
 
 
126 aa  248  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1240  hypothetical protein  44.26 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0899375  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0930  protein of unknown function DUF86  47.58 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.922217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3202  hypothetical protein  47.11 
 
 
127 aa  114  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.317376  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0016  hypothetical protein  47.46 
 
 
124 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1519  protein of unknown function DUF86  39.62 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.2684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0548  hypothetical protein  31.9 
 
 
114 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2463  hypothetical protein  32.5 
 
 
78 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.227725  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1813  hypothetical protein  25.64 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.691748  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5819  protein of unknown function DUF86  36.36 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0505  hypothetical protein  34.48 
 
 
115 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0868  protein of unknown function DUF86  33.62 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0018  ISSod9 hypothetical protein  26.89 
 
 
125 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.231151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3558  hypothetical protein  31.25 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107769  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0169  ISSod9 hypothetical protein  26.89 
 
 
125 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.194296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4166  hypothetical protein  30.21 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2451  hypothetical protein  26.42 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000252259  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0295  protein of unknown function DUF86  30.77 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.603584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3785  protein of unknown function DUF86  28.95 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.129087  normal  0.515713 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2758  hypothetical protein  28.81 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2287  hypothetical protein  28.09 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3118  hypothetical protein  25.74 
 
 
112 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1112  hypothetical protein  27.68 
 
 
120 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1880  protein of unknown function DUF86  32.67 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1729  hypothetical protein  31.03 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.993735  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1854  protein of unknown function DUF86  32.67 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1804  protein of unknown function DUF86  25 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1037  protein of unknown function DUF86  35.38 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0341749  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2149  protein of unknown function DUF86  23.47 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0089  hypothetical protein  30.77 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2705  hypothetical protein  28.24 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3483  protein of unknown function DUF86  24.71 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1407  hypothetical protein  23.96 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0885  hypothetical protein  32 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152206  hitchhiker  0.00000000727244 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0034  protein of unknown function DUF86  35.29 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.225981  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0370  hypothetical protein  28.4 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.823692  normal  0.271446 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2973  protein of unknown function DUF86  27.5 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0373  hypothetical protein  30.3 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.368479  normal  0.363257 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0032  hypothetical protein  25.86 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.89444  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3136  protein of unknown function DUF86  27.5 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.29369 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1165  hypothetical protein  37.31 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1083  protein of unknown function DUF86  29.89 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1202  protein of unknown function DUF86  25.37 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1369  hypothetical protein  20.34 
 
 
123 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.150444  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1935  protein of unknown function DUF86  25.47 
 
 
112 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  20.18 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0997  protein of unknown function DUF86  30 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0512778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0203  protein of unknown function DUF86  24 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2871  protein of unknown function DUF86  28.89 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  0.932974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0899  hypothetical protein  33.85 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84236  unclonable  0.000014673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2496  protein of unknown function DUF86  25 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1076  protein of unknown function DUF86  26.67 
 
 
117 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.814498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>