71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3202 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3202  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  258  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.317376  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0930  protein of unknown function DUF86  53.72 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.922217  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1240  hypothetical protein  44.35 
 
 
130 aa  123  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0899375  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0016  hypothetical protein  44.54 
 
 
124 aa  115  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1208  protein of unknown function DUF86  47.11 
 
 
126 aa  114  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1519  protein of unknown function DUF86  45.19 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.2684  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0505  hypothetical protein  37.72 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0868  protein of unknown function DUF86  36.84 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1165  hypothetical protein  38.1 
 
 
69 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3558  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107769  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2463  hypothetical protein  32.05 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.227725  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3785  protein of unknown function DUF86  32.46 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.129087  normal  0.515713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1112  hypothetical protein  30.36 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1341  protein of unknown function DUF86  33.64 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0295  protein of unknown function DUF86  31.19 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.603584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1804  protein of unknown function DUF86  32.22 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2871  protein of unknown function DUF86  35.24 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  0.932974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3689  hypothetical protein  27.03 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.119376  hitchhiker  0.00953852 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3483  protein of unknown function DUF86  34 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0370  hypothetical protein  29.81 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.823692  normal  0.271446 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1729  hypothetical protein  33.78 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.993735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0548  hypothetical protein  27.96 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2451  hypothetical protein  28.57 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000252259  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2705  hypothetical protein  26.32 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5819  protein of unknown function DUF86  28.83 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2973  protein of unknown function DUF86  32.53 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3136  protein of unknown function DUF86  32.53 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.29369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3118  hypothetical protein  31.25 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1202  hypothetical protein  27.1 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0520235  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2287  hypothetical protein  31.76 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2758  hypothetical protein  31.87 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0034  protein of unknown function DUF86  28 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.225981  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1880  protein of unknown function DUF86  30.12 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1854  protein of unknown function DUF86  30.12 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2496  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0089  hypothetical protein  26.09 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1076  protein of unknown function DUF86  31.73 
 
 
117 aa  47  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.814498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1695  hypothetical protein  28.75 
 
 
115 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.398533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3744  protein of unknown function DUF86  27 
 
 
119 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0549  hypothetical protein  28.72 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1969  hypothetical protein  28.77 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1813  hypothetical protein  28.41 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.691748  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1229  hypothetical protein  22.09 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.949454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2482  hypothetical protein  35.14 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09367  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2533  hypothetical protein  27.03 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0126172 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2071  protein of unknown function DUF86  28.12 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012332  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0153  hypothetical protein  24.36 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0203  protein of unknown function DUF86  23.6 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4166  hypothetical protein  27.93 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1765  protein of unknown function DUF86  24.11 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0018  ISSod9 hypothetical protein  28.57 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.231151  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0169  ISSod9 hypothetical protein  28.57 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.194296  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0604  hypothetical protein  26.67 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  22.67 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1202  protein of unknown function DUF86  23.26 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1935  protein of unknown function DUF86  29.17 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3038  protein of unknown function DUF86  27.62 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0275  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0885  hypothetical protein  26.67 
 
 
113 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152206  hitchhiker  0.00000000727244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1805  protein of unknown function DUF86  27.03 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3940  protein of unknown function DUF86  31.71 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2367  hypothetical protein  30.3 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.855839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0480  hypothetical protein  29.63 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1103  hypothetical protein  28.89 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0997  protein of unknown function DUF86  31.51 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0512778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3261  protein of unknown function DUF86  30.23 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1297  hypothetical protein  38.46 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1407  hypothetical protein  27.71 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0947  hypothetical protein  37.84 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.295502  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0032  hypothetical protein  27.47 
 
 
117 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.89444  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0257  protein of unknown function DUF86  31.75 
 
 
116 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>