13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3196 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3196  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  202  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.125791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0051  hypothetical protein  43.33 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4439  hypothetical protein  41.49 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41340  hypothetical protein  41.3 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0750  hypothetical protein  38.95 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.018724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61430  hypothetical protein  35.48 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.330544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5291  hypothetical protein  35.48 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0778  hypothetical protein  38.3 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0791  hypothetical protein  38.3 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0949  hypothetical protein  35.48 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.698299  normal  0.474864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5634  hypothetical protein  31.18 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0972  hypothetical protein  31.18 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4725  hypothetical protein  31.18 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>