13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4439 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4439  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0750  hypothetical protein  92.71 
 
 		 104 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.018724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0778  hypothetical protein  92.71 
 
 		 96 aa  180  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0791  hypothetical protein  91.67 
 
 		 96 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4725  hypothetical protein  76.04 
 
 		 95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5634  hypothetical protein  72.92 
 
 		 95 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0972  hypothetical protein  70.83 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0949  hypothetical protein  70.83 
 
 		 95 aa  134  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.698299  normal  0.474864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61430  hypothetical protein  65.62 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.330544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5291  hypothetical protein  64.58 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41340  hypothetical protein  64.89 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0051  hypothetical protein  45.56 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3196  hypothetical protein  41.49 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.125791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>