13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4725 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4725  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  191  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0972  hypothetical protein  82.11 
 
 		 95 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5634  hypothetical protein  82.11 
 
 		 95 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0750  hypothetical protein  81.25 
 
 		 104 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.018724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0778  hypothetical protein  81.25 
 
 		 96 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0791  hypothetical protein  79.17 
 
 		 96 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4439  hypothetical protein  76.04 
 
 		 96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0949  hypothetical protein  70.53 
 
 		 95 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.698299  normal  0.474864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5291  hypothetical protein  69.47 
 
 		 96 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61430  hypothetical protein  67.37 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.330544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41340  hypothetical protein  64.52 
 
 		 96 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0051  hypothetical protein  42.22 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3196  hypothetical protein  31.18 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.125791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>